MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS223 plasmid pS22302

Total Repeats: 179

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011668	ATTC	2	8	2	9	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011668	GCT	2	6	23	28	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011668	TGA	2	6	55	60	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011668	TCGG	2	8	76	83	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011668	TCGCT	2	10	89	98	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_011668	GCAA	2	8	125	132	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011668	ACC	2	6	176	181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_011668	ACC	2	6	184	189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_011668	CAT	2	6	254	259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011668	CAC	2	6	312	317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_011668	TTCGC	2	10	335	344	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_011668	GC	3	6	349	354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011668	GCGA	2	8	375	382	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011668	GAT	2	6	406	411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011668	AGCA	2	8	425	432	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011668	TTA	2	6	1420	1425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011668	TGA	2	6	1434	1439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011668	ATTT	2	8	1489	1496	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011668	CAG	2	6	2577	2582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011668	CTCC	2	8	2587	2594	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_011668	TTA	2	6	2620	2625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011668	TGC	2	6	2654	2659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011668	GAT	2	6	2692	2697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011668	TTG	2	6	2740	2745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011668	AGC	2	6	2803	2808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011668	TAC	2	6	2816	2821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011668	T	8	8	2873	2880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011668	GCC	2	6	2921	2926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_011668	A	6	6	2959	2964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011668	GTT	2	6	3056	3061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011668	TAAA	2	8	3104	3111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011668	ATT	2	6	3113	3118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011668	T	6	6	3117	3122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011668	GT	3	6	3218	3223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011668	TGG	2	6	3244	3249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011668	ATTA	2	8	3273	3280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011668	GAA	2	6	3352	3357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011668	T	7	7	3385	3391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011668	AT	3	6	3781	3786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011668	A	6	6	3799	3804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011668	GT	3	6	9820	9825	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011668	G	8	8	9839	9846	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011668	AC	3	6	10230	10235	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_011668	TTTG	2	8	10718	10725	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011668	CAT	2	6	30570	30575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011668	A	7	7	31300	31306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011668	TAA	2	6	31607	31612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011668	A	8	8	32259	32266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011668	ACT	2	6	32339	32344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011668	TC	3	6	32392	32397	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_011668	TA	3	6	32405	32410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011668	A	6	6	32420	32425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011668	T	7	7	32448	32454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011668	AGC	2	6	32540	32545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011668	A	6	6	32566	32571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011668	GCA	2	6	32600	32605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011668	TCT	2	6	32661	32666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011668	GT	3	6	32691	32696	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011668	GGC	2	6	33512	33517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011668	TC	3	6	33544	33549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011668	AAG	2	6	33647	33652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011668	CTTT	2	8	33669	33676	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011668	TAG	2	6	33693	33698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011668	ATT	2	6	33709	33714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011668	GCAA	2	8	33748	33755	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011668	CAG	2	6	33858	33863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011668	T	6	6	33971	33976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011668	TAG	2	6	34147	34152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011668	AGG	2	6	34166	34171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011668	GGA	2	6	34344	34349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011668	TAA	2	6	34415	34420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011668	AAG	2	6	34482	34487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011668	GCA	2	6	34499	34504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011668	CAA	2	6	34530	34535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011668	GAA	2	6	34580	34585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011668	AG	3	6	34726	34731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011668	CAA	2	6	34791	34796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011668	TGT	2	6	34856	34861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011668	TAG	2	6	34885	34890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011668	TGAT	2	8	34910	34917	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011668	TG	3	6	34941	34946	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011668	TTA	2	6	34955	34960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011668	T	6	6	34971	34976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011668	TAA	2	6	35025	35030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011668	A	6	6	35779	35784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011668	ATT	2	6	35869	35874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011668	GAA	2	6	35891	35896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011668	T	6	6	36021	36026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011668	GCG	2	6	36091	36096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011668	CAC	2	6	36143	36148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_011668	CTC	2	6	36150	36155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_011668	A	6	6	36186	36191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011668	AAT	2	6	36214	36219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011668	TGC	2	6	36288	36293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011668	CTG	2	6	36424	36429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011668	CCA	2	6	36471	36476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_011668	CAC	2	6	36539	36544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_011668	AAT	2	6	36580	36585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011668	CAT	2	6	36590	36595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011668	GAT	2	6	36645	36650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011668	TA	3	6	36770	36775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011668	TTA	2	6	36795	36800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011668	CCT	2	6	36835	36840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_011668	TAA	2	6	36920	36925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011668	AAG	2	6	36957	36962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011668	A	6	6	37078	37083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011668	T	6	6	37161	37166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011668	GTG	2	6	37204	37209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011668	CTCC	2	8	38614	38621	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
110	NC_011668	GTC	2	6	45495	45500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011668	T	6	6	45747	45752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011668	TAT	2	6	45797	45802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011668	TGG	2	6	45845	45850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011668	TAA	2	6	45860	45865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011668	TAC	2	6	45881	45886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011668	A	6	6	45964	45969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011668	CG	3	6	46068	46073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_011668	ATT	2	6	46108	46113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011668	AGT	2	6	46128	46133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011668	CTTC	2	8	46379	46386	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_011668	T	8	8	46396	46403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011668	ATG	2	6	47088	47093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011668	AT	3	6	47119	47124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011668	TTG	2	6	47232	47237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011668	CTG	2	6	47591	47596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011668	ACT	2	6	47602	47607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011668	GTA	2	6	47856	47861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011668	AC	3	6	48247	48252	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_011668	GT	3	6	48257	48262	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011668	GT	3	6	48269	48274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011668	ATAC	2	8	48275	48282	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_011668	GT	3	6	48287	48292	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011668	GT	3	6	48305	48310	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011668	ACAT	2	8	49030	49037	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011668	GT	3	6	49044	49049	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011668	T	6	6	49213	49218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011668	T	6	6	49221	49226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011668	TCAA	2	8	49307	49314	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_011668	AAT	2	6	49380	49385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011668	CAC	2	6	49396	49401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_011668	TG	3	6	50065	50070	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011668	GGC	2	6	50446	50451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_011668	GCG	2	6	50497	50502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_011668	CGC	2	6	50507	50512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_011668	CCCA	2	8	50648	50655	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
146	NC_011668	A	6	6	50681	50686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011668	A	6	6	50697	50702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011668	A	7	7	51368	51374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011668	GAA	2	6	51388	51393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011668	ATT	2	6	51472	51477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011668	CTTT	2	8	51516	51523	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_011668	AGT	2	6	51531	51536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011668	CTTA	2	8	59078	59085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_011668	CTA	2	6	59731	59736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_011668	CTTT	2	8	59922	59929	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_011668	A	6	6	59935	59940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011668	TACA	2	8	60157	60164	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
158	NC_011668	A	6	6	61106	61111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_011668	ACC	2	6	61189	61194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_011668	CAC	2	6	61200	61205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_011668	TAA	2	6	61264	61269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_011668	CAT	2	6	61360	61365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_011668	AAAGC	2	10	61374	61383	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
164	NC_011668	A	6	6	61891	61896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_011668	GCAA	2	8	61982	61989	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
166	NC_011668	CTG	2	6	62043	62048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_011668	A	6	6	62051	62056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_011668	AGA	2	6	62064	62069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_011668	TTGC	2	8	62123	62130	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
170	NC_011668	CGC	2	6	62257	62262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
171	NC_011668	GC	3	6	62264	62269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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173	NC_011668	A	6	6	64284	64289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_011668	G	6	6	64356	64361	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
175	NC_011668	GCG	2	6	65366	65371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_011668	CGC	2	6	65376	65381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
177	NC_011668	ATA	2	6	65399	65404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_011668	TAGC	2	8	65410	65417	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
179	NC_011668	GTG	2	6	65431	65436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.